リーナス・トーバルズは、自分の作品をFreak, Free, Unixを合成して「Freax」と呼ぼうと思っており、開発の初期の半年程の間は、彼はファイルを「Freax」というディレクトリに保存していた。トーバルズは「Linux」という名前も考えたが、最初はこれを自己中心的すぎるとして却下していた。
1991年の9月、ファイルは開発を促進するためにヘルシンキ技術大学のFTPサーバ (ftp.funet.fi) にアップロードされた。トーバルズの協力者で、当時そのサーバの責任者であったAri Lemmkeは、「Freax」という名前を良く思わず、彼はトーバルズに相談することなく、サーバ上のプロジェクトに「Linux」という名前をつけてしまった。しかし、その後トーバルズは「Linux」という名前をつけることに同意した。